CPD Results

The following document contains the results of PMD's CPD 5.2.3.

Duplications

File Line
com\delhezi\ga\mutation\heuristics\_2Opt.java 170
com\delhezi\ga\mutation\heuristics\LinKernighan.java 192
                if (selectEdge(chromosome, edge1iter, edge2iter) == true) {
                    //System.out.println("ZNALAZLEM. Odcinki edge1=" + edge1 +
                    //", edge2=" + edge2 + " należy usunąć.");
                    changeEdge(chromosome, edge1iter, edge2iter);
                    return;
                }

                //Ustaw edge2iter o jeden dalej.
                edge2iter = (edge2iter == chromosomeSize) ? 1 : edge2iter + 1;

                //ZAŁOŻENIE. edge1 nigdy nie jest rowne edge2
                if (edge2iter == edge2) {
                    //WYJŚCIE Z PETLI2
                    //USTAW edge2iter do następnej petli.
                    edge2iter = (edge2iter == chromosomeSize) ? 1 : edge2iter + 1;
                    koniec = true;

                    //Tu sprawdzamy czy po przesunieciu edge2iter wchodzi
                    //na edge1
                    //Nie musimy sprawdzać czy edge2 jest wewnątrz ścieżki
                    //"edge1-edge1iter", bo był przed ścieżką.
                      if (edge2iter == edge1) {
                        edge2iter = (edge1iter == chromosomeSize) ? 1
                            : edge1iter + 1;
                      }
                } else { //(edge2iter != edge2)

                  //Sprawdź czy edge2iter wchodzi na edge1.
                  //Jeśli tak to przeskocz nim za ścieżką "edge1-edge1iter".
                  if (edge2iter == edge1) {
                      //USTAW edge2iter za ścieżką "edge1-edge1iter"
                      edge2iter = (edge1iter == chromosomeSize) ? 1
                          : edge1iter + 1;

                      //edge2 jest we wnetrzu "edge1-edge1iter"
                      //WYJŚCIE Z PETLI2
                      if ((edge2 <= edge1iter) && (edge2 >= edge1)) {
                            koniec = true;
                            break; //GOTO2
                      } else {
                          //Sprawdź czy po przeskoczeniu ścieżki nie trafisz
                          //edge2iter == edge2. Nie musisz sprawdzać, czy dalej
                          //nie ma "edge1-edge1iter", bo już była.
                          if (edge2iter == edge2) {
                              //USTAW edge2iter do następnej petli !!!
                              edge2iter = (edge2iter == chromosomeSize) ? 1 : edge2iter + 1;
                              break; //GOTO2
                              }
                          }
                      } //if (edge2iter == edge1)
                    } //koniec //(edge2iter != edge2)
                } //----------- koniec PETLA 2

            //Tu wychodzimy z GOTO2

            edge1iter = (edge1iter == chromosomeSize) ? 1 : edge1iter + 1;

            //Ewentualna korekta edge2iter
            if (edge2iter == edge1iter) {
              edge2iter = (edge2iter == chromosomeSize) ? 1 : edge2iter + 1;
            }
        }
    }

    /**
     * Jeśli znaleziono lepszy cykl; Zamień "krzyżowo" ścieżki;
     * Przykład:
     * edge1=ab, edge2=cd
     * Zawsze odwracamy odcinek bc.
     * 1) dxxa-b12c-, edge1=ab=4, edge2=cd=8  --  wynik dxxa-c21b-
     * 2) xxa-b12c-dxx, edge1=ab=3, edge2=cd=7 -- wynik xxa-c21b-dxx
     * @param chromosome Chromosom.
     * @param edge1 Pierwsza krawędź, wartość z zakresu <1, chromosomeSize>
     *              np. edge1=4 dla xxxx-xxxx.
     * @param edge2 Druga krawędź, wartość z zakresu <1, chromosomeSize>
     *              np. edge2=8 dla xxxxxx-xx.
     * @since 1.0
     */
    protected final void changeEdge(Chromosome chromosome,
                                    final int edge1,
                                    final int edge2) {
        int chromosomeSize = chromosome.size();
        int pA;
        int pB;
        int pC;
        int pD;

        //Zawsze odwracamy punkty pomiędzy B a C.

            if (edge1 == chromosomeSize) { //bxxxxxxxxa-
               pA = edge1 - 1; //geny licza sie od 0
               pB = 0;
            } else { //xxxxxa-bxxx
               pA = edge1 - 1; //geny licza sie od 0
               pB = edge1;
            }

            if (edge2 == chromosomeSize) { //dxxxxxxxxc-
               pC = edge2 - 1; //geny licza sie od 0
               pD = 0;
            } else { //xxxxxc-dxxx
               pC = edge2 - 1; //geny licza sie od 0
               pD = edge2;
            }

        //Liczba genów podlegających inwersji.
        int inversionGenes = (pB < pC) ? pC - pB + 1
            : (chromosomeSize - pB) + pC + 1;

        //tmpGenes - sekcja inwersji po operacji inwersji.
        Object[] invGenes = new Object[inversionGenes];
        int ii;
        if (pB < pC) {
            ii = pC;
            for (int i = 0; i < invGenes.length; i++) {
                invGenes[i] = chromosome.getGene(ii);
                ii--;
            }
        } else {
            ii = 0;
            for (int i = pC; i >= 0; i--) {
                invGenes[ii++] = chromosome.getGene(i);
            }

            for (int i = chromosomeSize - 1; i >= pB; i--) {
                invGenes[ii++] = chromosome.getGene(i);
            }
        }

        int inv = 0;
        if (edge1 < edge2) {
            for (int i = edge1; i < edge2; i++) {
                chromosome.setGene(i, invGenes[inv]);
                inv++;
            }
        } else {
            for (int i = edge1; i < chromosomeSize; i++) {
                chromosome.setGene(i, invGenes[inv]);
                inv++;
            }
            for (int i = 0; i < edge2; i++) {
                chromosome.setGene(i, invGenes[inv]);
                inv++;
            }
        }
      chromosome.changed();
    }

    /**
     * Funkcja sprawdza, czy udało sie wybrać właściwe krawędzie do
     * usunięcia; Cykl po usunięciu wybraych krawędzi (edge1, edge2) oraz
     * po utworzeniu nowych "na krzyż" powinien być badziej optymalny;
     * Przykład:
     * dxxa-bxxc-, edge1=ab=4, edge2=cd=8
     * Jeśli długości odcinków ac+bd jest mniejsza niż ab+cd to
     * znaleziono cykl lepszy (zwróć true).
     * @param chromosome Chromosom.
     * @param edge1 Pierwsza krawędź, wartość z zakresu <1, chromosomeSize>
     *              np. edge1=4 dla xxxx-xxxx.
     * @param edge2 Druga krawędź, wartość z zakresu <1, chromosomeSize>
     *              np. edge2=8 dla xxxxxx-xx.
     * @return true, w przypadku kiedy usuniecie wybranych odcinków i
     * utworzenie nowych skraca cykl.
     * @since 1.0
     */
    protected final boolean selectEdge(Chromosome chromosome,
File Line
com\delhezi\ga\StateInitialized.java 35
com\delhezi\ga\StateStopped.java 35
    public StateInitialized(final GeneticAlgorithm ga) {
        this.ga = ga;
    }

    /**
     * Uruchamia działanie algorytmu gentycznego.
     * @throws GeneticAlgorithmException xxx
     * @since 1.0
     */
    @Override
    public final void run() throws GeneticAlgorithmException {
        ga.setState(GeneticAlgorithmState.RUNNING);

        while ((ga.getPopulation().getGeneration() <
                ga.getMaxGenerationCount() ||
                ga.getMaxGenerationCount() < 1) &&
               (ga.getPopulation().getGeneration() -
                ga.getPopulation().getTopChromosomeGenerationFound() <
                ga.getLastGenerationTopChromosomeFind() ||
                ga.getLastGenerationTopChromosomeFind() < 1)) {

            if (ga.getState() != GeneticAlgorithmState.RUNNING) {
                return;
            }

            ga.getPopulation().generation();
        }

        if (ga.getState() != GeneticAlgorithmState.ERROR) {
            ga.setState(GeneticAlgorithmState.STOPPED);
        }
    }

    /**
     * Zatrzymuje działanie algorytmu gentycznego.
     * @throws GeneticAlgorithmException xxx
     * @since 1.0
     */
    @Override
    public final void stop() throws GeneticAlgorithmException {
        return;
    }

    /**
     * Zwraca status algorytmu gentycznego.
     * @return Status algorytmu gegentycznego.
     * @since 1.0
     */
    @Override
    public final GeneticAlgorithmState getState() {
        return GeneticAlgorithmState.INITIALIZED;
File Line
com\delhezi\ga\mutation\heuristics\_2Opt.java 110
com\delhezi\ga\mutation\heuristics\LinKernighan.java 129
        assert chromosome != null : "Illegal argument chromosome: null";

        int chromosomeSize = chromosome.size();

        //Krawędź edge1 powininna zawierać się w obszare chromosomu.
        assert (edge1 >= 1 && edge1 <= chromosomeSize)
            : "Illegal argument edge1: " + edge1;
        //Krawędź edge2 powininna zawierać się w obszare chromosomu.
        assert (edge2 >= 1 && edge2 <= chromosomeSize)
            : "Illegal argument edge2: " + edge2;

        //Dla chromosomeSize <= 3 dowolne połączenie jest optymalne
        if (chromosomeSize <= 3) {
            return;
            }

        //Szukamy deterministycznie, wiec przestawiamy krawędzie
        if (edge1 == edge2) {
            edge2 = (edge2 == chromosomeSize) ? 1 : ++edge2;
        }

        int edge1iter = edge1;
        int edge2iter = edge2;
        boolean koniec = false;
        int tmpEdge1IterNext;

        //Sprawdź czy edge2iter nie jest bezpośrednio po edge1iter lub
        //edge2iter nie pokrywa się z edge1iter.
        //Jeśli tak to zmiana krawędzi nie zmieni porządku genów w chromosomie,
        //więc od razu przestawiamy edge2iter do kolejnego przypadku.
        tmpEdge1IterNext = (edge1iter == chromosomeSize) ? 1 : edge1iter + 1;
        if (tmpEdge1IterNext == edge2iter) {
            edge2iter = (edge2iter == chromosomeSize) ? 1 : edge2iter + 1;
        }

        //Poszukuj iterakcyjnie lepszego cyklu dla ścieżki.
        //Kręć PETLA 2 i zwiekszaj w każdym obrocie edge2iter+1 (lub
        //przejdź na początek jeśli edge2iter dojdzie do końca tablicy).
        //Jeśli edge2 zatoczyło koło to zwiększ edge1+1 i ponownie
        //kręć PETLA 2 zwiększając w każdej iterakcji edge2+1
        //do wyczerpania wszystkich możliwości.
        //Pomiń pary ścieżek powtarzające się w edge1 i edge2.
        for (int i1 = 0; i1 < chromosomeSize - 2; i1++) { //PETLA 1

        // TU SĄ ZAWSZE PRZYGOTOWANE ZMIENNE edge1iter, edge1, edge2iter, edge2.

            //----------- PETLA 2
            koniec = false;
            while (koniec == false) { //Zakończ jeśli zatoczysz pełne koło
                                      //z edge2.
                                //Możlie wyjście przez break wówczas idziemy
                                //do pętli zewnętrznej do GOTO2

                //Licznik ilości podjętych prób.
                if (counter == 0) {
                    return;
                }
                counter--;

                //Sprawdź, czy po zmianie uzyskamy lepszy cykl.
                if (selectEdge(chromosome, edge1iter, edge2iter) == true) {
File Line
com\delhezi\ga\GeneticAlgorithmXmlDomParserFactory.java 99
com\delhezi\ga\GeneticAlgorithmXmlSaxParserFactory.java 121
            throw new GeneticAlgorithmException(ex.getMessage());
        }
          if (fitnessFunctionOption == FitnessFunctionOption.minimisation) {
            fitnessFunction.setMaximisation(false);
        } else if (fitnessFunctionOption == FitnessFunctionOption.maximisation) {
            fitnessFunction.setMaximisation(true);
          }

          ChromosomeProperties chromosomeProperties =
              ChromosomeProperties.getInstance();
          chromosomeProperties.setFitnessFunction(fitnessFunction);

          LinkedList<Chromosome> chromosomes = null;
          switch (initializeDataSource) {
        case sampleTSP:
              chromosomes = SampleTsp.newChromosomes(populationSize, chromosomeProperties);
              break;
        case db:
              //UZUPEŁNIĆ
              //initializePopulationConnectionName
              //initializePopulationSQLQuery
              chromosomes = null;
              break;
            }

        switch (populationType) {
        case PopulationChangeableSize:
              try {
                  population = PopulationChangeableSize.newPopulationChangeableSize(
                      maxLT, minLT, chromosomes,
                      crossoverOperator, crossoverProbability,
                      mutationOperator, mutationProbability,
                      chromosomeProperties);
            } catch (GeneticAlgorithmException ex) {
                LOGGER.log(Level.SEVERE, null, ex);
                throw new GeneticAlgorithmException(ex.getMessage());
File Line
com\delhezi\ga\mutation\heuristics\_2Opt.java 335
com\delhezi\ga\mutation\heuristics\LinKernighan.java 360
    protected final boolean selectEdge(Chromosome chromosome,
                                       final int edge1,
                                       final int edge2) {

        int chromosomeSize = chromosome.size();
        double sizeAB;
        double sizeCD;
        double sizeAC;
        double sizeDB;
        Point pA, pB, pC, pD;

            if (edge1 == chromosomeSize) { //bxxxxxxxxa-
               pA = (Point) chromosome.getGene(edge1 - 1); //geny licza sie od 0
               pB = (Point) chromosome.getGene(0);
            } else { //xxxxxa-bxxx
               pA = (Point) chromosome.getGene(edge1 - 1); //geny licza sie od 0
               pB = (Point) chromosome.getGene(edge1);
            }
            sizeAB = distance(pA.getx(), pA.gety(), pB.getx(), pB.gety());