com.delhezi.ga

Class Chromosome<GENE_TYPE>

java.lang.Object

com.delhezi.ga.Chromosome<GENE_TYPE>

Type Parameters:

GENE_TYPE - typ obiektu charakteryzujący gen np.: Integer, Double, lub objekt klasy com.delhezi.genes.*. Uwaga; Genami nie mogą być typy proste np. int, double.

All Implemented Interfaces:

Cloneable, Comparable<Chromosome<GENE_TYPE>>

public class Chromosome<GENE_TYPE>
extends Object
implements Cloneable, Comparable<Chromosome<GENE_TYPE>>

Chromosome: Klasa chromosomu.

Version:

1.0 2009-06-10

Author:

Wojciech Wolszczak

Constructor Summary

Constructors

Constructor and Description
Chromosome(GENE_TYPE[] genes, ChromosomeProperties chromosomeProperties) Konstruktor.

Method Summary

Methods

Modifier and Type	Method and Description
void	changed() Funkcja zmienia status chromosomu na "zmodyfikowany"; Status chromosomu należy zmienić po operacjach: - bezpośrednio na tabeli genów po uzyskaniu referencji do tabeli, jeśli zmiana odbyła się z pominięciem funkcji setGenes() lub setGene(); - przy zmianie referencji do IMutation, jeśli zmiana odbyła się z pominięciem funkcji setMutation(); - przy zmianie referencji do IFitnessFunction, jeśli zmiana odbyła się z pominięciem funkcji setFitnessFunction().
Chromosome<GENE_TYPE>	clone() Kopiuje chromosom.
int	compareTo(Chromosome<GENE_TYPE> chromosome) Porównanie dwóch chromosomów; if x.compareTo(y) == 1 to x jest lepszy niż y.
double	getFitness() Wylicza i zwraca wartość wskaźnika przystosowania.
GENE_TYPE	getGene(int locus) Zwraca gen ze wskazanej pozycji (locus).
GENE_TYPE[]	getGenes() Zwraca referencję do tablicy genów; Uwaga; Zwracana jest referencja do tablicy a nie jej kopia; Jeśli za pomocą otrzymanej referencji dojdzie do modyfikacji wartości tablicy należy wykonać funkcję changed() klasy Chromosome w celu ponownego wyznaczenia wskaźnika przystosowania chromosomu.
boolean	isFitnessMaximisation() Zwraca parametr określający maksymalizację/minimalizację funkcji celu.
void	mutation(IMutation mutation) Mutacja.
void	setGene(int locus, GENE_TYPE gene) Wstawia gen na wskazaną pozycję (locus).
void	setGenes(GENE_TYPE[] genes) Wstawia referencję do tablicy genów; Uwaga; Wstawiana jest referencja do tablicy a nie jej kopia; Jeśli po wstawieniu referencji dojdzie do modyfikacji watrości tablicy należy wykonać funkcję changed() klasy Chromosome w celu ponownego wyznaczenia wskaźnika przystosowania chromosomu.
int	size() Zwraca ilość genów w chromosomie.
String	toString() String charakteryzujący chromosom.

Methods inherited from class java.lang.Object

equals, getClass, hashCode, notify, notifyAll, wait, wait, wait

Constructor Detail

Chromosome

public Chromosome(GENE_TYPE[] genes,
          ChromosomeProperties chromosomeProperties)

Konstruktor.

Parameters:

genes - Tablica genów.

chromosomeProperties - Referencja do obiektu przechowującego parametry wspólne dla wszystkich chromosomów w ramach jednej instancji populacji.

Since:

1.0

Method Detail

compareTo

public final int compareTo(Chromosome<GENE_TYPE> chromosome)

Porównanie dwóch chromosomów; if x.compareTo(y) == 1 to x jest lepszy niż y. Wykorzystywane przy sortowaniu. UWAGA. LISTA POSORTOWANA JEST W ODWROTNEJ KOLEJNOŚCI CHYAB JAKIŚ BŁĄD W JAVA

Specified by:

compareTo in interface Comparable<Chromosome<GENE_TYPE>>

Parameters:

chromosome - Chromosom do porównania.

Returns:

0 jeśli wartości wskażników przystosowania chromosomów porównywanych są równe, 1 lub -1 jeśli jeden większy od drugiego.

isFitnessMaximisation

public final boolean isFitnessMaximisation()

Zwraca parametr określający maksymalizację/minimalizację funkcji celu.

Returns:

true - maksymalizacja funkcji celu (najlepszym jest osobnik o najwiekszej wartości wskaźnika przystosowania) false - minimalizacja funkcji celu (najlepszym jest osobnik o najmniejszej wartości wskaźnika przystosowania)

mutation

public final void mutation(IMutation mutation)

Mutacja.

Parameters:

mutation - Funkcja mutacji

Since:

1.0

size

public final int size()

Zwraca ilość genów w chromosomie.

Returns:

Ilość genów w chromosomie.

Since:

1.0

getFitness

public final double getFitness()
                        throws GeneticAlgorithmException

Wylicza i zwraca wartość wskaźnika przystosowania.

Returns:

Wartość wskaźnika przystosowania.

Throws:

GeneticAlgorithmException - xxx

Since:

1.0

changed

public final void changed()

Funkcja zmienia status chromosomu na "zmodyfikowany"; Status chromosomu należy zmienić po operacjach: - bezpośrednio na tabeli genów po uzyskaniu referencji do tabeli, jeśli zmiana odbyła się z pominięciem funkcji setGenes() lub setGene(); - przy zmianie referencji do IMutation, jeśli zmiana odbyła się z pominięciem funkcji setMutation(); - przy zmianie referencji do IFitnessFunction, jeśli zmiana odbyła się z pominięciem funkcji setFitnessFunction().

getGene

public final GENE_TYPE getGene(int locus)

Zwraca gen ze wskazanej pozycji (locus).

Parameters:

locus - Pozycja genu (locus).

Returns:

Gen określonego typu.

Since:

1.0

setGene

public final void setGene(int locus,
           GENE_TYPE gene)

Wstawia gen na wskazaną pozycję (locus).

Parameters:

locus - Locus pod którym ma być wstawiony gen.

gene - Wstawiany gen określonego typu.

Since:

1.0

getGenes

public final GENE_TYPE[] getGenes()

Zwraca referencję do tablicy genów; Uwaga; Zwracana jest referencja do tablicy a nie jej kopia; Jeśli za pomocą otrzymanej referencji dojdzie do modyfikacji wartości tablicy należy wykonać funkcję changed() klasy Chromosome w celu ponownego wyznaczenia wskaźnika przystosowania chromosomu.

Returns:

Referencja do tablicy genów.

Since:

1.0

setGenes

public final void setGenes(GENE_TYPE[] genes)

Wstawia referencję do tablicy genów; Uwaga; Wstawiana jest referencja do tablicy a nie jej kopia; Jeśli po wstawieniu referencji dojdzie do modyfikacji watrości tablicy należy wykonać funkcję changed() klasy Chromosome w celu ponownego wyznaczenia wskaźnika przystosowania chromosomu.

Parameters:

genes - Referencja do tablicy genów.

Since:

1.0

clone

public final Chromosome<GENE_TYPE> clone()

Kopiuje chromosom. Ze względu na konieczność skopiowania tablicy genów wymagane jest "głębokie kopiowanie"; SPITOLONA FUNCKJA WYMAGA UOGÓLNIENIA DO PRZERÓBKI;

Overrides:

clone in class Object

Returns:

Głęboka kopia chromosomu.

Since:

1.0

toString

public final String toString()

String charakteryzujący chromosom.

Overrides:

toString in class Object

Returns:

String charakteryzujący chromosom.

Since:

1.0